Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOT2Q8IXI1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms