Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms