Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms