Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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SAMD13Q5VXD3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SAMD13Q5VXD3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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