Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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PRAMEF20Q5VT98 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PRAMEF20Q5VT98 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PRAMEF20Q5VT98 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PRAMEF20Q5VT98 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PRAMEF20Q5VT98 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PRAMEF20Q5VT98 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PRAMEF20Q5VT98 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PRAMEF20Q5VT98 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PRAMEF20Q5VT98 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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