Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms