Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL40Q2TBA0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL40Q2TBA0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms