Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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