Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF239Q16600 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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