Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FXNQ16595 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms