Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC6Q16204 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC6Q16204 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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