Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIX1Q15475 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SIX1Q15475 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms