Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IRF4Q15306 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms