Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERC3Q15034 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HERC3Q15034 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HERC3Q15034 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HERC3Q15034 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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