Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NWD1Q149M9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms