Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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