Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms