Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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COL4A6Q14031 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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COL4A6Q14031 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL4A6Q14031 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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