Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms