Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1SQ13698 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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