Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CUL4AQ13619 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CUL4AQ13619 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CUL4AQ13619 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CUL4AQ13619 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CUL4AQ13619 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CUL4AQ13619 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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