Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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