Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TPRKB-201ENST00000272424 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL606490.5-201ENST00000413071 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CSRP3-201ENST00000265968 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SPRR3-202ENST00000331860 985 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL096677.1-201ENST00000442884 814 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC079385.2-201ENST00000547531 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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