Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EVL-214ENST00000555048 1715 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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UBE2V1Q13404 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
UBE2V1Q13404 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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