Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFT88Q13099 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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