Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP160Q12769 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms