Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC15Q0P6D6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms