Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNB2Q08289 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNB2Q08289 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms