Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SOX4Q06945 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms