Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DSC2Q02487 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DSC2Q02487 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DSC2Q02487 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DSC2Q02487 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms