Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms