Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKOR1P84550 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms