Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LOXL3P58215 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LOXL3P58215 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms