Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3M2P53677 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AP3M2P53677 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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