Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GTF2A2P52657 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GTF2A2P52657 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms