Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMARCA2P51531 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms