Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCLMP48507 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms