Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ATRXP46100 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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