Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GRIA1P42261 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIA1P42261 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIA1P42261 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms