Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ETFBP38117 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ETFBP38117 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms