Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM23P36406 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM23P36406 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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