Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GCAP28676 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GCAP28676 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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