Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRGP23470 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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