Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
XPAP23025 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XPAP23025 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XPAP23025 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XPAP23025 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XPAP23025 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XPAP23025 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms