Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PGAM1P18669 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms