Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VCLP18206 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VCLP18206 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VCLP18206 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms