Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJA1P17302 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA1P17302 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms