Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms