Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTN1P12814 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms