Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM225BP0DP42 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms